Władzami Szczecińskiego Przedsiębiorstwa Autobusowego „Klonowica” Sp. z o.o. są:
- Zgromadzenie Wspólników:
Prezydent Miasta Szczecin – Piotr Krzystek
- Rada Nadzorcza
Przewodniczący – Piotr Kęsik
Wiceprzewodniczący – Stefan Mazurkiewicz
Sekretarz – Artur Pomianowski
Członek – Ryszard Ciupa
Członek – Bohdan Rola
- Zarząd:
Prezes Zarządu – Krzysztof Putiatycki